本中心歷年所建置的模型主要應用於經濟、能源、環境及社會領域的議題分析，其中又以經濟與能源領域的政策評估為最大宗。經濟領域議題涵括：經濟預測、資源配置分析、全球價值鏈分析、特定事件之經濟影響等；能源領域議題則涵括：能源政策評估、新及再生能源技術經濟分析、能源價格及負載預測等。近年隨著經濟社會的問題日益複雜，議題分析的面向已不再單純，整合多面向議題分析能力的模型也應運而生。本中心因應此一趨勢，已發展數個相關模型，例如，2020年執行國發會「臺灣減碳可能路徑與因應」委託計畫所建置之模型，除經濟及社會面設定外，也詳細納入我國能源使用、發電技術、綠能技術發展等特性，以模擬綠能及溫室氣體減量政策對能源、經濟、所得分配及環境之影響；另外，2020-2023年執行科技部委託之科技政策評估模型建置計畫，更將科技政策、產業政策、能源政策及環境政策等諸多面向整合入模型中，以捕捉各政策與其他政策間之互動，以完整評估各項政策所可能帶來的影響。